化学起源于魔术。除了巫师，谁能喷一口烟就变出戏法呢？方士珍视转化物质的能力，他们用佶屈聱牙的语言和炼金术符号来描述秘方，将信息编码隐蔽在寓言或宗教故事中，但这样做也不利于化学的发展。我一直在寻思：今天的药物化学家可能仍然对存在于动物体内传奇的石头（如牛*）特别感兴趣，想知道这种石头来自什么样的动物，疗效如何。然而，借用一位诺贝尔文学奖获得者鲍勃·迪伦（BobDylan）的话说：“时代已变。”与神秘的“炼金术士”的方法不同，Berzelius（——）建议化合物应该基于组成它们的成分命名，ArchibaldScott-Couper（——）于年首先用线表示分子中原子之间的连接，产生了如今容易理解的分子结构图。年，Jean-HenriHassenfratz和PierreAugusteAdet创建的符号对《化学命名法》（MethodedeNomenclatureChimique）进行补充，这对化学信息来说是革命性的。混乱甚至不正确的化学命名法被现代的化学符号所取代，如氧、氢和氯化钠。这使得拉瓦锡（Lavoisier）的新化学得以系统化。在这新科学哲学创建的“启蒙时代”，信息要被实验验证、被“科学家们”（WilliamWhewell于年首倡的词汇）所检验；信息将数据置于化学的核心。
随着化学知识和语言的积累，化学领域的信息研究进入新的时期。重要事件如贝尔斯登（FriedrichBeilstein，——）编纂的《有机化学手册》（年出版）系统地收集了化合物、反应和性质等化学数据。为了能“大”规模（个化合物）地存储和检索化学信息，化合物的命名是关键一环。化学数据标引的目的是让化学数据能可靠地被存储和检索，以此为目标所做的努力是随后半个世纪中化学信息研究的主要特征。随着化学（及其许多相关学科）创新（和数据收集）能力的不断增强，问题从“如何合成一种化合物”到“一种化合物以前有没有被合成过”演变，回答起来也变得复杂和耗时。我记得在Well
